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Resumen y cronología de las variantes del SARS-CoV-2

Escrito por Yidan Gao, editado por Edward Chen y LisaMichelle Pecaro

Traducido al español por Deivy Castellano

Abril de 2021 está a la vuelta de la esquina. Hace un año, los gobiernos de todo el mundo pidieron a casi 4.000 millones de personas que se quedaran en casa y se prepararan para un cierre de un mes para frenar la propagación del COVID-19. Durante el año 2020, se han realizado muchos avances significativos en la comprensión de la virología, el desciframiento del genoma del SARS-CoV-2, la exhortación al uso de mascarillas y el desarrollo de vacunas. Pero justo cuando estamos trabajando intensamente para combatir el virus, el SARS-CoV-2 muta silenciosamente en varias variantes nuevas que pueden infectar mejor a los humanos y evadir el sistema inmunitario.


Hay varias cepas conocidas de SARS-CoV-2 que han llamado la atención del público y que circulan por todo el mundo. En orden cronológico, estas cepas son

  • D614G: Apareció por primera vez en Europa en marzo de 2020.

  • B.1.427 y B.1.429: Circulan en Los Ángeles, California, y fueron identificadas por investigadores de la UC San Francisco en julio de 2020.

  • B.1.351: Se informó en Sudáfrica a principios de octubre de 2020.

  • B.1.1.7: Se informó en el Reino Unido el 14 de diciembre de 2020. Sin embargo, las autoridades de salud pública de Inglaterra sospechaban que esta variante había surgido ya en septiembre de 2020.

  • P.1: Se detectó durante un control rutinario de viajeros brasileños que llegaban a Japón a principios de enero de 2021.

  • B.1.526: Surgió a principios de marzo de 2021, y atrajo la atención local debido a su rápida propagación en la ciudad de Nueva York. El primer caso de B.1.526 surgió alrededor de noviembre de 2020.


La figura anterior fue creada por Yidan Gao.

Este podcast sigue la línea de tiempo ordenada de la detección de variantes.

 

Empecemos con la primera variante, la variante D614G, que se describió detalladamente en uno de nuestros blogs anteriores. D614G se refiere a una mutación puntual en el residuo de aminoácido 614, de ácido aspártico (D) a glicina (G), que se produce en la glucoproteína spike del SARS-CoV-2. La proteína de la espiga, como se describe en nuestros blogs anteriores, es un objetivo popular para la mutación. Este cambio en la secuencia de aminoácidos modifica la estructura de la proteína y aumenta su afinidad de unión con el receptor que utiliza para infectar a los humanos. La afinidad de unión se refiere a la fuerza de la interacción entre una proteína, en este caso, la proteína de la espiga, y su compañero de unión, la proteína ACE2, que es un receptor que se encuentra en las células del huésped humano. Veremos que este tema de la afinidad de unión aumentada aparece varias veces en nuestra discusión.


B.1.427 y B.1.429 fueron dos cepas de coronavirus encontradas predominantemente en el estado de California el pasado mes de julio. Las mutaciones en B.1.427 incluyen dos mutaciones puntuales de la proteína de la espiga en los residuos 452 y 614, respectivamente. En B.1.429 se encontraron dos residuos mutantes adicionales de la espiga en los residuos 12 y 152. Los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) incluyeron recientemente a B.1.427/429 como variantes preocupantes, junto con B.1.1.7, B.1.351 y P.1, debido a un aumento de la transmisibilidad de aproximadamente un 20%. Este aumento de la contagiosidad está probablemente asociado a estas mutaciones puntuales, que ayudan al virus a evadir el sistema inmunitario al escapar del reconocimiento de los anticuerpos.


Tres meses después, en octubre, se reconoció la variante B.1.351 en Sudáfrica. Esta variante se extendió a Estados Unidos a finales de enero de 2021. Según los CDC, no ha habido pruebas de que la B.1.351 cause más enfermedades. Sin embargo, el hecho de que esta variante tenga muchas más mutaciones plantea cierta preocupación a los científicos a la hora de predecir la eficacia de la vacuna. En concreto, la mutación puntual de la proteína de la espiga en el residuo 484, que cambia el ácido glutámico (E) por la lisina (K), podría hacer que la variante fuera moderadamente resistente a los anticuerpos monoclonales durante las aplicaciones terapéuticas, según un documento de 2020.


Dos meses más tarde, la variante B.1.1.7 apareció silenciosamente en el Reino Unido. Esta variante ha sido tratada en uno de nuestros blogs anteriores. Fue reconocida por el público a mediados de diciembre y pronto se extendió a los Estados Unidos a finales de diciembre de 2020. Los epidemiólogos informaron de que la nueva variante tiene una mayor transmisibilidad y se convirtió en la cepa dominante en los EE.UU. sólo 3 meses después de su llegada. Las tres mutaciones específicas de la cepa B.1.1.7 son las más preocupantes. Dos de ellas son mutaciones puntuales que cambian los aminoácidos en los residuos 501 y 681. La otra mutación implica una supresión de los aminoácidos 69 y 70 en el tallo de la proteína de la espiga. Estas mutaciones aumentan la afinidad de unión de la espiga del SARS-CoV-2 al receptor ACE2 de las células epiteliales del huésped. La aparición de esta cepa vírica dio lugar a numerosas investigaciones sobre su asociación con la mortalidad. En un estudio de cohortes emparejadas, Challen et al. realizaron un seguimiento de 54.000 pacientes con COVID desde el 1 de octubre de 2020 hasta el 29 de enero de 2021 y midieron la muerte en los 28 días siguientes a una prueba de COVID positiva. La tasa de mortalidad aumentó del 0,25% para las variantes existentes anteriormente al 0,41% para los pacientes infectados con la cepa B.1.1.7.


La variante P.1 se originó en Brasil y se extendió a Estados Unidos más o menos al mismo tiempo que la B.1.351. Esta cepa viral estaba muy extendida en Manaos, una ciudad de Brasil. Dado que algunos residentes de Manaos se volvieron a infectar después de la recuperación, es probable que la variante P.1 evada el efecto neutralizador de los anticuerpos generados tras una primera infección.


A partir del 26 de marzo de 2021, la B.1.526 no está incluida en el sitio web de los CDC entre las "variantes preocupantes". Sin embargo, la B.1.526 se está abriendo paso como una de las variantes más comunes que circulan en Nueva York y Nueva Jersey. Los funcionarios del gobierno de Nueva Jersey hicieron una pausa en los planes de reapertura para evitar las reuniones sociales y la transmisión en la comunidad. Esta nueva variante contiene mutaciones en la proteína de la espiga, similares a las de cepas anteriores, incluidas las que se asocian a una posible resistencia a los anticuerpos. Sin embargo, aún se desconoce mucho sobre esta cepa viral específica.


Las descripciones anteriores cubren la mayoría de las variantes prevalentes a partir del 27 de marzo de 2021. Para obtener más información actualizada sobre cada variante, puede visitar el sitio web de los CDC, que enumera muchas de las variantes que hemos mencionado. Aunque algunas variantes virales plantean la preocupación de que puedan evadir parcialmente la inmunidad generada por las vacunas, las vacunas COVID aprobadas siguen provocando amplias respuestas inmunitarias que probablemente seguirán funcionando contra las variantes. También se están preparando vacunas de refuerzo específicas para estas nuevas variantes. La Organización Mundial de la Salud insta a la población a vacunarse si puede hacerlo.


Aunque el virus muta y puede hacer que algunas intervenciones terapéuticas o vacunas sean menos eficaces, las medidas preventivas, como el uso de una máscara y el distanciamiento social, siguen siendo herramientas poderosas para mantenernos a nosotros mismos y a nuestra comunidad a salvo.

 

Este articulo fue publicado originalmente en inglés el 27 de marzo de 2021. Los resultados de las investigaciones en curso y los conocimientos actuales sobre el COVID-19 están en constante evolución. Este artículo contiene información que fue actualizada por última vez el 27 de marzo de 2021.

 

Edward Chen is a master's student studying immunology. He's also the national president of Students vs. Pandemics. @EdwrdChen

 

Edward Chen es un estudiante de maestría que estudia inmunología. También es el presidente nacional de Students vs. Pandemics. @EdwrdChen

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